Все институты власти имеют свои полномочия и не могут выходить за их пределы.
Ни один орган власти не может игнорировать или приостанавливать деятельность других институтов (конституционно закрепленных).
Президент (по конституции) ни к одной ветви власти не относится. Он занимает особое место, обеспечивает согласование функций властей. Физически, он – глава исполнительной власти.
Создаются основы независимого правосудия:

Конституционное собрание (для пересмотра ряда положений Конституции, кроме глав 1,2,9).
Возобновлена деятельность Конституционного суда.

Укрепились основы деятельности Совета безопасности РФ (нормативные, организационные).

Противоречия между правовым разделением властей в России и реальностью

Гипертрофия функций Президента за счет ограничения других институтов.
Подконтрольность правительства только Президенту.
Президент и Дума (всенародное голосование) ответственности не несут за деятельность правительства, хотя участвуют в его формировании.
Госдума зависит от решений Совета Федерации (который формируется на основе регионального представительства).
Законодательная деятельность Федерального Собрания (парламента) ограничена правом Президента издавать указы (подзаконные акты), имеющие силу закона.

Основные направления развития системы разделения властей в РФ

Четкое разделение функций всех ветвей власти. Полная независимость судебной власти.
Совершенствование «механизма издержек и противовесов».
Выборность всех ветвей власти и честные выборы, то есть дальнейшая демократизация общества.
Совершенствование системы формирования Совета Федерации Федерального Собрания РФ.
Огранить функции Президента РФ. Прежде всего, возможность издания подзаконных актов.
Повысить ответственность правительства за всё происходящее в обществе.
Переход к президентско-парламентской форме правления государства в значительной мере решить перечисленные проблемы:

Правительство:

формируется партийным большинством в парламенте, опирается на его поддержку и ответственно перед ним.

Президент:

безопасность государства (внешняя и внутренняя).

Премьер-министр:

экономика и социальная сфера, ответственен перед парламентом.